Para pacientes suspeitos de terem cancro da próstata, nem a ecografia, nem a ressonância magnética, nem mesmo os testes de PSA, podem diagnosticar definitivamente o cancro da próstata. Actualmente, o padrão ouro para o diagnóstico do cancro da próstata é o relatório patológico de uma biópsia de punção de tecido. O relatório de patologia indica geralmente o tipo de tecido utilizado para o cancro da próstata, tal como o adenocarcinoma alveolar da próstata; e a pontuação de Gleason, um método de classificação histológica para o cancro da próstata que está intimamente relacionado com o comportamento e prognóstico biológicos. Há dois indicadores de avaliação com uma pontuação total de 10. Uma pontuação de 2, 3 ou 4 corresponde a adenocarcinoma altamente diferenciado (baixo risco); uma pontuação de 5, 6 ou 7 corresponde a adenocarcinoma moderadamente diferenciado (risco intermédio); e uma pontuação de 8, 9 ou 10 corresponde a cancro baixo/undiferenciado (alto risco). Foi também dividido em três níveis de <7 pontos, =7 pontos, >7 pontos. Nesta perspectiva, uma biopsia de punção do cancro da próstata com pontuação 5 é considerada de risco baixo a moderado.
Mas como se trata de uma amostra perfurada, existe alguma margem de erro e probabilidade, pelo que a avaliação clínica da criticidade, opções de tratamento e prognóstico de um cancro da próstata ainda requer uma combinação do estado geral do paciente, pontuação de Gleason, nível de PSA, e fase do tumor.