Os sintomas mais salientes são a azia e o refluxo ácido, cujo grau varia de pessoa para pessoa, e a sua ocorrência depende da sua patogénese. O refluxo gastro-esofágico é causado principalmente por três factores: 1) o movimento peristáltico do esófago e a capacidade reduzida de o limpar; 2) o relaxamento do esfíncter cardíaco inferior; 3) a retenção gástrica, a obstrução do esvaziamento gástrico e o abrandamento do esvaziamento. São principalmente estes três factores que causam a retenção do conteúdo gástrico, provocando o aumento da secreção de ácido gástrico e mesmo o refluxo da bílis e da azia.