O tratamento do HPV varia consoante a infecção seja de alto risco ou de baixo risco. Se a infecção pelo HPV for de baixo risco, está geralmente associada ao condiloma acuminado, que ocorre no tracto genital externo, como a vulva ou área perianal. Para esta condição, pode ser considerada a aplicação tópica de gel de interferão humano recombinante a2b combinado com tratamento a laser para remover as verrugas, bem como medicação antiviral oral, tal como comprimidos de aciclovir. Além disso, se a biopsia indicar NIC grau 2, poderá ser necessária cirurgia de LEEP cervical, e se NIC grau 3, poderá ser necessária conização cervical ou histerectomia. Em conclusão, é importante identificar o estadiamento da infecção por HPV, uma vez que esta está directamente relacionada com o tratamento subsequente e testes associados.