A hipotermia funcional é quando o corpo está num estado de febre baixa na ausência de patologia orgânica. Tipicamente, as mulheres experimentam uma hipotermia funcional após a ovulação. As crianças com um metabolismo rápido podem ter uma hipotermia funcional após a actividade. Além disso, alguns pacientes com hipertiroidismo e um metabolismo rápido podem também desenvolver uma hipotermia funcional.