Clinicamente, o tratamento da enterite hemorrágica inclui os seguintes aspectos: Primeiro, os pacientes recebem tratamento anti-infeccioso e, normalmente, recebem um grande número de antibióticos de largo espectro para tratamento anti-infeccioso, para expandir o volume de sangue do paciente, e para corrigir o desequilíbrio de água, electrólitos e ácido-base. Os doentes também têm de jejuar água, descompressão gastrointestinal, nutrição parenteral elevada e outros tratamentos sintomáticos e de apoio, se necessário, podem utilizar medicamentos hormonais, que podem inibir a resposta inflamatória do doente. Em segundo lugar, o tratamento cirúrgico, na parte clínica dos pacientes aparecerá sintomas hemorrágicos graves, e alguns pacientes aparecerão também perfuração intestinal, e alguns pacientes aparecerão mesmo obstrução intestinal grave, desta vez após o efeito do tratamento não cirúrgico não ser bom, deve ser cirurgia precoce. Após o tratamento cirúrgico, os pacientes devem prestar atenção para reforçar o tratamento anti-infeccioso, para manter o equilíbrio da flora intestinal dos pacientes, de modo a que estes possam recuperar bem. Em geral, a enterite hemorrágica tem um curso mais perigoso e uma taxa de mortalidade mais elevada, pelo que lhe deve ser dada atenção suficiente na prática clínica.