Antes de tratar a esofagite micotrópica, é importante compreender as causas da esofagite micotrópica e tratá-las em conformidade. As principais causas incluem a utilização a longo prazo de doses elevadas de medicamentos antibacterianos de largo espectro. Além disso, o uso crónico de grandes quantidades de hormonas adrenocorticotrópicas e doses elevadas prolongadas de radiação, bem como doses elevadas de drogas imunossupressoras. Na desnutrição, na velhice, algumas doenças debilitantes, cirurgia, etc., resultando num sistema imunitário baixo, podem produzir uma diminuição da fagocitose leucocitária e da função bactericida, podem produzir micose esofágica. A micose fungóide é uma combinação de prevenção e tratamento, em primeiro lugar, a prevenção de infecções causadas por factores médicos e o controlo rigoroso das indicações para o uso de antibióticos e hormonas. Os principais métodos de tratamento são a fitoterapia e a medicina ocidental, com a fitoterapia incluindo a san de lata, Yunnan Baiyao, e a alicina. Os medicamentos ocidentais incluem micoplasma, cetoconazol, fluconazol, itraconazol e outros tratamentos antibacterianos, todos eles eficazes.