A fase aguda da SIDA ocorre geralmente cerca de duas semanas após a infecção, e os sintomas duram 1-3 semanas e depois resolvem-se gradualmente. Os sintomas na fase aguda são principalmente febre alta, dor de garganta, gânglios linfáticos inchados, erupção cutânea, dores musculares e articulares, dores de cabeça, diarreia, úlceras da boca, suores nocturnos, e em alguns casos, a perda de peso, e os sintomas na fase aguda são semelhantes aos da gripe grave. Os sintomas agudos são frequentemente descritos como sintomas semelhantes aos da gripe, ou sintomas de mononucleose infecciosa. Os principais sintomas da mononucleose infecciosa são febre, dores de garganta, gânglios linfáticos inchados e erupções cutâneas. Os sintomas mais comuns na fase aguda da SIDA são febre, dor de cabeça, dores musculares e articulares, e uma erupção cutânea relativamente pouco comum. Os gânglios linfáticos inchados porque podem aparecer em muitas pessoas não infectadas com SIDA podem também ter gânglios linfáticos inchados. A presença destes sintomas não significa necessariamente que se esteja infectado com SIDA, mas se se tiver tido um comportamento de alto risco e estes sintomas aparecerem durante a fase aguda, recomenda-se que se faça um teste de anticorpos para esclarecer se estes sintomas provêm da fase aguda da SIDA.