H. pylori em si não causa dor abdominal, mas a gama de doenças que causa pode levar a dor abdominal. O H. pylori pode sobreviver num ambiente fortemente ácido e é a única bactéria que pode sobreviver no estômago. H. pylori pode causar danos na mucosa gástrica, levando à gastrite erosiva, úlceras gástricas, úlceras duodenais, e pode mesmo induzir cancro gástrico, entre outras coisas. Helicobacter pylori causa gastrite erosiva, que pode levar a desconforto como dor e inchaço no abdómen superior. Se levar a úlcera gástrica e úlcera duodenal, pode causar dor abdominal superior crónica, periódica e rítmica. As úlceras gástricas são predominantemente dolorosas após as refeições, e as úlceras duodenais são predominantemente dolorosas com fome, pelo que a infecção do corpo por H. pylori pode levar a uma série de perturbações que podem causar dor abdominal. Se for encontrado um H. pylori positivo no exame físico, deve ser administrado um tratamento padrão anti-H. pylori.