O tratamento da gastroenterite baseia-se na causa da doença. As cefalosporinas podem ser utilizadas para infecções bacterianas, enquanto que as cefalosporinas não são geralmente recomendadas para infecções virais. Para infecções bacterianas, as bactérias comuns incluem Campylobacter, Shigella, Vibrio cholerae, etc. Podem ser utilizados antibióticos como levofloxacina, safranina e cefalosporinas, juntamente com medicamentos para proteger a mucosa gastrointestinal e para parar a diarreia. As infecções virais que causam gastroenterite incluem rotavírus, norovírus, astrovírus e adenovírus entéricos, etc. Os antibióticos podem causar diarreia ou promover o crescimento de bactérias resistentes aos medicamentos e não são recomendados. Além disso, o tratamento com cefalosporina não é recomendado para gastroenterite causada por infecções parasitárias, mas sim medicamentos antiparasitários tais como artemisinina, quinino e triquostatina. Para pacientes com gastroenterite, a medicação deve ser administrada sob supervisão médica. Se necessário, podem ser utilizados sais de rehidratação oral ou reidratação intravenosa para reabastecer os electrólitos para assegurar o equilíbrio dos fluidos e evitar a desidratação. Durante o período de tratamento, comer uma dieta leve, evitar estímulos picantes, hidratar e manter quente para evitar sintomas agravantes.