A gastroenterite é geralmente causada por infecções microbianas, mas também pode ser causada por venenos químicos ou drogas. A apresentação clínica típica é diarreia, náuseas, vómitos e dores abdominais. As infecções virais são a causa mais comum de gastroenterite. Existem vários vírus que podem causar gastroenterite, sendo o mais comum o rotavírus, seguido pelo norovírus, astrovírus e enteroadenovírus. O tratamento mais importante para a gastroenterite é a hidratação e os electrólitos. Os pacientes geralmente só precisam de descansar e beber quantidades suficientes de água (por exemplo, solução de sal re-hidratante oral). Mesmo os pacientes que estão a vomitar devem beber tanta água quanto possível. Os lactentes em amamentação devem continuar a amamentar. As bebidas carbonatadas, chá, bebidas desportivas, bebidas com cafeína e sumos de fruta não são adequados para re-hidratação. Se houver vómitos ou diarreia prolongada ou desidratação grave, poderá ser necessária uma reidratação intravenosa. Os antieméticos podem ser adicionados em casos de vómitos graves. Se a diarreia durar mais de 24 a 48 horas e não houver indicação de uma infecção bacteriana mais grave, podem ser adicionados medicamentos anti-diarreicos. A auto-administração de medicamentos antieméticos e antidiarreicos não é normalmente recomendada para crianças. Como os antibióticos podem causar diarreia ou promover o crescimento de bactérias resistentes aos medicamentos, geralmente não são recomendados mesmo que o agente causador da gastroenterite seja conhecido. No entanto, certas infecções bacterianas patogénicas (por exemplo Campylobacter, Shigella, Vibrio cholerae) ou pacientes com diarreia do viajante podem ser tratadas com antibióticos. Para a gastroenterite devido a infecções virais, os antibióticos não são eficazes. A gastroenterite devida a infecções parasitárias requer medicamentos antiparasitários. A gastroenterite nas crianças progride rapidamente e as perturbações electrolíticas são um problema muito perigoso, pelo que não deve ser tomada de ânimo leve e deve ser tratada prontamente por um médico.