Como tratamento minimamente invasivo, o principal inconveniente da cirurgia de ablação do cancro do pulmão é que alguns cancros do pulmão não são adequados para tratamento de ablação, ou seja, o tratamento de ablação do cancro do pulmão tem contra-indicações rigorosas, e as contra-indicações comuns incluem: 1. Aqueles com riscos graves e outros; 5. aqueles com lesões metastáticas difusas no pulmão; 6. quando há um pacemaker no corpo do paciente, o tratamento de ablação por radiofrequência não pode ser feito. Haverá complicações após a ablação do cancro do pulmão, mesmo complicações graves. As complicações gerais não são tão traumáticas para os doentes com cancro do pulmão, tais como pneumotórax causado durante a cirurgia, uma pequena quantidade de hemoptise não é grave, e por vezes há a presença de hemoptise, que requer embolização intervencionista para interferir. Além disso, a infecção da parte ablacionada do tumor pode ocorrer após a ablação. Mesmo alguns doentes podem desenvolver fístula pleuro-traqueal, o que é uma complicação mais grave. Embora a terapia de ablação seja um tratamento minimamente invasivo muito bom para o cancro do pulmão, também tem desvantagens.