CA199 é um glicogénio com um valor normal inferior a 37,00 U/ml. Um ligeiro aumento de CA199 pode ser observado em doenças benignas, mas se CA199 for mais de dez ou mesmo dezenas de vezes superior ao normal, ou se CA199 for persistentemente elevado, a possibilidade de tumor deve ser considerada. É frequentemente utilizado no diagnóstico diferencial do cancro pancreático, cancro gastrointestinal e outros tumores. Quando o CA199 é elevado em maior grau, é mais provável que indique um tumor no fígado, vesícula biliar ou pâncreas. Contudo, o CA199 não é o único indicador que pode identificar directamente um tumor. Os exames de TC e RM do fígado, vesícula biliar ou pâncreas devem ser feitos prontamente, e biópsias patológicas locais, tais como biópsias guiadas e perfuradas, também podem ser usadas para fazer um diagnóstico definitivo. Quando tumores malignos do fígado, vesícula biliar ou pâncreas estão presentes, para além de elevações anormais no CA199, também são observadas elevações no CA242 e devem ser prontamente investigadas. Para além disso, CA199 ligeiramente elevado pode também ser associado a inflamação ginecológica, bem como a doenças do sistema biliar e do sistema digestivo, tais como massas benignas como pólipos e quistos, ou a presença de doença inflamatória pélvica, pancreatite crónica, cálculos da vesícula biliar, hepatite e cirrose hepática podem também levar a CA199 elevado. Algumas mulheres grávidas, ou fumadoras ou bebedeiras de longa duração, podem também ter CA199 elevado, o que é um resultado falso-positivo e pode ser novamente verificado para confirmar o diagnóstico. As pacientes com CA199 elevado são aconselhadas a ir prontamente ao hospital para completar os testes relevantes e submeter-se ao tratamento sob a orientação de um médico. Se o tumor for diagnosticado, a cirurgia deve ser realizada para remover o tumor e a quimioterapia e radioterapia podem ser utilizadas para controlar o desenvolvimento da doença e evitar a sua deterioração.