O tempo que um doente pode viver com carcinoma escamoso hipofractorizado depende da recuperação do doente após o tratamento e da ocorrência de metástases. O carcinoma escamoso hipofractado indica um grau relativamente elevado de malignidade, e as células cancerosas são mais susceptíveis de metástases numa fase precoce do tumor, com infiltração e invasão local, etc. O prognóstico geral é pior do que o de um carcinoma escamoso médio a alto diferenciado. Contudo, a estimativa de sobrevivência depende da fase do tumor, ou seja, se o tumor é detectado a tempo e se se trata de um tumor em fase inicial. Se o carcinoma escamoso hipofractorizado for detectado a tempo, antes de ocorrer qualquer metástase, e se receber tratamento anti-tumoral padronizado a tempo, ainda pode alcançar resultados mais satisfatórios e até curar a sobrevivência a longo prazo, mas para o carcinoma escamoso hipofractorizado avançado, o tempo de sobrevivência esperado é de cerca de meio ano a um ano, e espera-se que seja pior do que o do carcinoma escamoso fraccionado médio e elevado. O tempo de sobrevivência para o carcinoma escamoso hipofracionado avançado, contudo, é esperado ser de cerca de seis meses a um ano, e é esperado ser pior do que o do carcinoma escamoso de grau médio a alto. Em conclusão, a sobrevivência dos doentes com carcinoma escamoso hipofractado não pode ser generalizada, mas o diagnóstico e tratamento precoces podem prolongar a sua sobrevivência.