Foi sugerido que a gonorreia está mais associada à infertilidade masculina. O mecanismo de ocorrência inclui lesões dos órgãos genitais e lesões do trato reprodutor, como orquite e epididimite induzidas pela gonorreia, ou uretrite masculina induzida pela gonorreia, vesicoureterite, vasculite, prostatite e estenose uretral que ocorre numa fase posterior do trato reprodutor causada por estenose e atresia pode ser secundária à infertilidade. A principal complicação da gonorreia na mulher é a doença inflamatória pélvica gonorreica, na qual a inflamação crónica das trompas de Falópio pode causar aderência tubária, bloqueio, derrame, etc., resultando frequentemente em infertilidade ou gravidez ectópica. Quanto maior for o número de infecções gonocócicas, maior será a incidência de infertilidade. Além disso, a gonorreia pode pôr em perigo a geração seguinte. Se uma mulher grávida estiver infetada com gonorreia, um pequeno número de casos pode causar infecções intra-amnióticas ou septicemia pós-parto, etc. O feto pode ser infetado ou o seu desenvolvimento pode ser prejudicado no útero, levando a um parto prematuro, nado-morto ou septicemia neonatal e conjuntivite gonorreica neonatal.