Em geral, os medicamentos anti-inflamatórios não têm efeito sobre a vacinação, mas se o doente tiver manifestações inflamatórias agudas como febre ou diarreia, então a vacinação não é adequada. As vacinas são normalmente injectadas no corpo para estimular o sistema imunitário e produzir os anticorpos correspondentes para prevenir e controlar doenças. Os anti-inflamatórios não afectam normalmente a função imunitária do corpo, pelo que normalmente não afectam o efeito da vacina, e é raro que os anti-inflamatórios reajam com a vacina e produzam reacções adversas. No entanto, se a pessoa vacinada for uma criança ou uma pessoa com o corpo enfraquecido, é aconselhável consultar as autoridades competentes para saber se é possível receber a vacina depois de tomar os anti-inflamatórios, uma vez que a resistência pode ser menor. Embora os próprios anti-inflamatórios não tenham efeito na vacinação, a razão pela qual o paciente os toma precisa de ser esclarecida, uma vez que são geralmente tomados porque o paciente sofre de uma doença infecciosa e a maioria das vacinas não estão disponíveis se fizerem parte de uma infecção aguda. A vacinação pode agravar a manifestação da inflamação, aumentar a carga sobre o sistema imunitário e pode também ter um efeito sobre a eficácia da vacina. Como a imunidade do paciente é baixa durante a fase aguda da inflamação, a vacinação, neste caso, pode também produzir outras reacções adversas.