É útil tomar amoxicilina para a enterite, mas a amoxicilina não é o medicamento preferido. O medicamento preferido é o probiótico, tal como Clostridium typhimurium comprimidos vivos ou Bacillus subtilis cápsulas vivas, porque os probióticos podem desempenhar um papel na regulação dos distúrbios da flora intestinal, pelo que podem ser utilizados para tratar diarreia, obstipação, desconforto abdominal e outros sintomas que ocorrem em doentes com enterite. A amoxicilina é um antibiótico de largo espectro, embora tenha um forte efeito mortal tanto sobre bactérias gram-negativas como gram-positivas, mas é principalmente adequado para as vias respiratórias, vias urinárias, e também infecções do tracto biliar, bem como febre tifóide. Se precisar de utilizar antibióticos para tratar infecções intestinais, os antibióticos preferidos são as quinolonas, como a norfloxacina, que é mais comummente utilizada na prática clínica, mas antes de utilizar antibióticos, os pacientes precisam de cooperar com os médicos para melhorar o exame relevante, apenas se houver uma presença clara de infecção bacteriana e se se tratar de uma infecção grave, é possível utilizar antibióticos para evitar o aparecimento de resistência bacteriana aos medicamentos.