De acordo com as últimas directrizes da Federação Internacional de Obstetrícia e Ginecologia para o rastreio do cancro do colo do útero, a vigilância genética do HPV combinada com a citologia é a nova força motriz no rastreio e tratamento do cancro do colo do útero. Em comparação com outros métodos de rastreio do cancro do colo do útero, a monitorização genética do HPV é menos afectada por factores humanos, tem alta sensibilidade e é utilizada para o rastreio populacional com uma taxa de faltas inferior a 5% e um valor preditivo negativo de 99%. Para mulheres com mais de 30 anos de idade, a monitorização do HPV é utilizada como rastreio primário e os subtipos de alto risco do HPV (16 e 18) combinados com a citologia como rastreio secundário, que é actualmente um protocolo de rastreio com melhor classificação.