A diarréia com fezes aquosas verdes é causada por enterite aguda e desequilíbrio da flora intestinal. Durante a enterite aguda, os músculos lisos da parede intestinal movem-se rapidamente devido à inflamação no sistema intestinal, e o conteúdo do intestino é expelido rapidamente. Como o intestino não tem tempo para absorver a água, as fezes que saem são espessas e contêm muita água. As fezes são de natureza ácida porque permanecem no intestino durante um tempo relativamente curto. As fezes contêm uma certa quantidade de bilirrubina, que é oxidada à bilirrubina num ambiente ácido, pelo que os pacientes com enterite aguda terão fezes aquosas verdes. Existe uma certa quantidade de bactérias prejudiciais no tracto intestinal, que é normalmente suprimida. Uma vez que as bactérias nocivas tenham crescido em excesso, afectará a função intestinal, especialmente quando a Pseudomonas aeruginosa tiver crescido em excesso, não só causará diarreia, mas também a cor das fezes aparecerá azul-esverdeada.