Muitas pessoas têm doenças intestinais e o seu médico recomenda uma colonoscopia. Na maioria dos casos, as colonoscopias não são muito incómodas e podem ser toleradas. No entanto, muitas pessoas, por razões psicológicas e físicas, terão problemas mais incómodos. O colonoscópio utilizado para a colonoscopia é um instrumento em forma de tubo com um determinado diâmetro. O colonoscópio tem de entrar pela abertura anal até à região ileocecal e, durante o processo de entrada, produz-se uma sensação semelhante à defecação, que é contínua. Esta sensação pode tornar-se incómoda. Além disso, durante a colonoscopia, o médico tem de insuflar constantemente, encher de água, injetar antiespuma e outros medicamentos para ver claramente o aspeto do interior do intestino, pelo que há uma dilatação localizada do intestino e estas operações podem provocar uma sensação de inchaço. Algumas pessoas, por exemplo, podem considerar estes desconfortos mais incómodos. O desconforto está certamente presente durante o exame, mas não há nada que possa ser feito para aliviar o desconforto do doente. Atualmente, as colonoscopias são mais frequentemente realizadas sob anestesia, na maior parte dos casos utilizando anestesia intravenosa, em que os medicamentos são administrados por via intravenosa e o exame é monitorizado de perto por um anestesista, o que não só é seguro como também minimiza o desconforto durante o exame. Embora exista desconforto associado à colonoscopia, este pode ser atenuado com as condições médicas actuais. Para as pessoas que necessitam de ser examinadas, é aconselhável fazê-lo rapidamente.