Os principais medicamentos utilizados para tratar a infecção por Mycoplasma pneumoniae são macrolídeos, quinolonas, tetraciclinas, etc. Os macrolídeos incluem azitromicina, roxitromicina, claritromicina, etc. A mais comummente utilizada é a azitromicina, que é um medicamento oral de acção prolongada com duas opções de tratamento, sendo os pacientes aconselhados a certificarem-se de ler as instruções antes de utilizarem o medicamento. As quinolonas incluem principalmente levofloxacina, cloridrato de moxifloxacina, ciprofloxacina, etc. Se a idade >18 anos para a infecção por micoplasma, ainda se recomenda a aplicação das quinolonas. Devido ao abuso de drogas antimicrobianas na China actualmente, a taxa de resistência do micoplasma aos macrolídeos é muito elevada, pelo que é melhor usar quinolonas para aqueles com >18 anos de idade. Mas se <18 anos, só podem ser utilizados macrólidos, porque as quinolonas são proibidas com menos de 18 anos de idade. As tetraciclinas têm relativamente mais efeitos secundários, e especialmente para crianças podem também ter dentes de tetraciclina, e são geralmente usadas apenas quando não há nenhuma droga de escolha.