Os cogumelos shiitake mal cozinhados podem causar intoxicação alimentar, pelo que se recomenda que sejam bem cozinhados antes de serem consumidos. Os cogumelos shiitake são cogumelos comestíveis de uso comum. Se não forem manuseados corretamente e consumidos em grandes quantidades, podem causar sintomas de intoxicação como náuseas, vómitos, dores abdominais, diarreia, etc. Isto deve-se ao facto de crescerem num ambiente húmido e estarem contaminados com muitas bactérias na sua superfície. Isto deve-se ao facto de os cogumelos shiitake serem cultivados num ambiente húmido com um elevado nível de contaminação da superfície por fungos, o que pode levar a uma intoxicação alimentar bacteriana e fúngica se não forem suficientemente aquecidos. Os cogumelos shiitake são ricos em valor nutricional, cada 100 gramas de cogumelos shiitake frescos e perfumados contêm 26 calorias, das quais 2,2 gramas de proteínas, 5,2 gramas de hidratos de carbono, 0,3 gramas de gordura, 2 miligramas de cálcio, 0,3 miligramas de ferro. O consumo correto pode fornecer ao corpo o valor nutricional acima referido, o que é benéfico para a saúde humana. Os cogumelos shiitake devem ser consumidos escolhendo cogumelos frescos e cozinhados, e os cogumelos que tenham sido submetidos a moldes não devem ser ingeridos para evitar afetar a sua saúde. Os cogumelos shiitake crus devem ser limpos e não devem ser consumidos por pessoas alérgicas aos cogumelos shiitake.