O hipotiroidismo congénito não é geralmente curável. O hipotiroidismo congénito, ou hipotiroidismo congénito, é uma condição congénita que requer uma terapia de substituição vitalícia. O hipotiroidismo congénito pode ser dividido em primário e secundário, de acordo com o local da lesão. O hipotiroidismo primário é o resultado de doença da própria glândula tiróide, sendo as anomalias congénitas da glândula tiróide a causa primária, e outras causas como a síntese deficiente de hormonas da tiróide e a baixa resposta da glândula tiróide ou órgãos-alvo. O hipotiroidismo secundário é menos comum e é causado por perturbações TSH no hipotálamo e na hipófise, geralmente devido ao hipopituitarismo idiopático ou a defeitos de desenvolvimento do hipotálamo e da hipófise. Uma vez diagnosticada, a condição requer medicação a longo prazo para regular os níveis da hormona tiroidiana. O medicamento de escolha para o tratamento do hipotiroidismo congénito é levotiroxina, começando com pequenas doses e aumentando-as gradualmente até se obter uma eficácia óptima. As pessoas em terapia de substituição a longo prazo devem ser monitorizadas quanto ao peso e função cardíaca para prevenir osteoporose, pseudotumores ou agravamento da doença cardíaca aterosclerótica coronária causada por overdose da hormona tiroidiana.