O tempo até ao cancro da hiperplasia atípica está principalmente relacionado com o grau de hiperplasia, o tratamento e factores individuais do doente, não podendo ser generalizado. Em geral, a hiperplasia atípica pode evoluir para carcinoma in situ no prazo de 1 a 2 anos se não for objeto de uma intervenção atempada, mas devem ser analisados problemas específicos. Se a hiperplasia atípica for ligeira ou moderada e os sintomas forem ligeiros, a doente pode tornar-se normal em 90% dos casos após intervenção ou remoção dos factores causais. No entanto, se o doente tiver uma hiperplasia atípica grave, é geralmente difícil de reverter e pode evoluir para cancro, apenas cerca de 30% podem recuperar e a maioria dos doentes evoluirá para cancro em fase inicial em cerca de 2 anos, pelo que deve ser acompanhado de perto e gerido ativamente. Os doentes são aconselhados a ter em atenção o estabelecimento de um estilo de vida saudável, a fazer uma dieta leve, a evitar alimentos picantes e irritantes e a evitar o álcool em geral.