Existem muitas doenças do sistema imunitário como o LES, vitiligo e espondilite anquilosante, por isso é importante determinar se a vacinação pode ser dada com base na classificação, gravidade e apresentação clínica da doença, e se a vacinação pode ser dada se a doença for estável e em boas condições, ou não. Deve ser feito um exame de saúde completo antes da vacinação para doenças do sistema imunitário, e a vacina só deve ser administrada após a doença estar estável e livre de reacções adversas e complicações, e após a obtenção da aprovação do médico assistente. Como a maioria dos pacientes com doenças do sistema imunitário necessita de medicação a longo prazo para controlar a sua condição, se estiverem sob medicação, podem consultar o seu médico se precisarem de parar de a tomar durante um período de tempo antes de poderem receber a vacina da Nova Coroação. Para além dos doentes com doenças do sistema imunitário, os doentes com outras doenças crónicas como a hipertensão e diabetes, aqueles que se estão a preparar para a gravidez e as mulheres que amamentam devem também ser seleccionados para a vacinação. A vacina não deve ser administrada às mulheres durante a gravidez, às que são alérgicas aos componentes da vacina, às que sofrem de doenças agudas, às que sofrem de doenças crónicas e às que sofrem de doenças mentais.