Depois de o VIH ter infectado o corpo, existem certos sintomas durante a fase aguda, geralmente cerca de 2-4 semanas após a infecção pelo VIH. Isto é quando algumas pessoas têm sintomas clínicos devido à replicação do VIH no corpo, o que leva a danos no sistema imunitário. Os sintomas mais comuns são febre, mal-estar geral, náuseas, vómitos, dores de cabeça, dores nas articulações, diarreia, gânglios linfáticos inchados e assim por diante. De facto, a maioria destes sintomas são ligeiros e podem resolver-se sozinhos em cerca de 1-3 semanas, e o ARN e o antigénio P24 do VIH podem ser detectados no sangue do paciente durante este período. O diagnóstico pode ser confirmado por estes testes, após o que o doente entra num longo período assintomático, que demora cerca de 6-8 anos. Eventualmente, o doente entrará na fase da SIDA, durante a qual terá muitos sintomas, tais como febre persistente, suores nocturnos, diarreia, perda de peso, e sintomas de infecção em vários sistemas de órgãos.