A gastroenterite durante a amamentação manifesta-se frequentemente por dor abdominal, náuseas, vómitos, passagem de fezes finas em pasta e febre. A amamentação é um momento especial para se ter cuidado na utilização de medicamentos e os testes sanguíneos de rotina devem ser aperfeiçoados. Se houver uma elevação clara de leucócitos e neutrófilos, representando uma infecção inflamatória, o paciente é aconselhado a tratar com antibióticos, uma vez que a infecção tem um efeito sobre o feto, e portanto deve ser tratada com anti-infecção, escolhendo frequentemente antibióticos cefalosporinos, que são menos prejudiciais para o bebé, para além de medicamentos anti-diarreicos como o montelukast, e medicamentos para regular a flora intestinal, tais como rectificar o intestino.