O melhor medicamento para tratar os nódulos nos pulmões depende da causa do nódulo causador do pulmão, o mais comum clinicamente é um pseudotumor inflamatório que se forma devido a uma resposta inflamatória. Por exemplo, devido a infecção bacteriana, podem ser escolhidos antibióticos como a penicilina, amoxicilina, claritromicina, azitromicina, clindamicina, cefoperazona sulbactam sódio e outros medicamentos. Se o nódulo pulmonar for devido a uma bola de tuberculose no pulmão causada pela infecção por Mycobacterium tuberculosis, deve ser escolhida uma combinação de drogas anti-tuberculose tais como isoniazida, rifampicina, etambutol, pirazinamida, estreptomicina e levofloxacina. Se o nódulo pulmonar for claramente canceroso por biopsia, então devem ser escolhidos e combinados medicamentos anticancerígenos tais como cisplatina e vincristina para o melhor resultado.