Os tipos raros de verrugas são: (1) verruga genital queratohc (verruga genital queratinizada) uma superfície espessada, queratinizada, muito semelhante a uma verruga comum ou queratose seborreica, sobretudo em superfícies secas; (2) verruga genital papilar lisa (verruga genital papilar lisa) uma verruga em forma de cúpula, de cor semelhante à da pele, frequentemente em áreas relativamente secas, tais como o pénis, e outras superfícies da pele; (3) achatada As verrugas natgenitais são difíceis de identificar directamente a olho nu e são uma lesão subclínica que normalmente requer técnicas especiais (por exemplo, tratamento da superfície da pele com uma solução de ácido acético a 3%-5%) para detectar.