Não é aceitável limpar apenas o ânus para obter um certificado de saúde. Normalmente, é necessário utilizar uma zaragatoa anal inserida no ânus para recolher uma amostra e o simples facto de limpar o ânus pode afetar a precisão do teste. Quando se efectua um exame de fezes anais, é geralmente possível identificar a presença de parasitas intestinais ou doenças infecciosas, por exemplo. O principal objetivo da prova do esfregaço anal para a obtenção de um certificado de saúde é detetar a presença de infecções bacterianas, virais ou parasitárias, que geralmente podem ser transmitidas por via fecal-oral, fluidos corporais ou a outras pessoas através de gotículas. As pessoas que necessitam de um certificado sanitário estão geralmente em contacto com os alimentos dos clientes ou têm contacto direto com eles, pelo que é necessário realizar cuidadosamente uma zaragatoa anal e não apenas uma zaragatoa anal. Se o resultado do teste for negativo, o paciente é saudável; se for positivo, o resultado do teste é anormal e indica geralmente a presença de uma patologia correspondente no trato intestinal, geralmente infeção tifoide, infeção por bacilo da disenteria, infeção por bacilo da tuberculose, infeção parasitária, etc. A presença destas patologias afectará geralmente o processo de emissão do certificado de saúde. Se for necessário efetuar um exame de fezes para a obtenção do certificado sanitário, é importante que a amostra seja conservada de forma adequada. É igualmente importante evitar a contaminação da amostra durante o teste, o que pode afetar os resultados.