As verrugas podem ser brancas, rosadas ou cinzentas, e a sua superfície pode ser vesicular, escorrimento, ulceração, hemorragia ou infecção. Inicialmente, as lesões são simples, múltiplas ou aglomerados de pequenos grânulos avermelhados com uma textura suave e uma ponta ligeiramente afiada, por vezes tão pequenas que são indistinguíveis a olho nu. As lesões aumentam gradualmente de tamanho e podem ser papilares, couve-flor ou de forma coronal. Nos homens, ocorrem nos mamilos, sulco coronal, prepúcio, uretra, pénis e períneo, e nas mulheres nos lábio majora e minora, abertura vaginal, clítoris, vagina, colo do útero, períneo e área perianal. Em homossexuais, ocorre no ânus e recto. Em alguns pacientes, pode ocorrer em outras áreas para além da genitália anal, tais como a boca, axilas, seios e unhas.