Os doentes com uretrite não-gonocócica terão normalmente um aumento anormal dos glóbulos brancos nos seus testes de urina de rotina e terão um aumento de bactérias. Também, em alguns doentes com IU, há um aumento dos glóbulos vermelhos na rotina da urina, que é resultado de danos na mucosa causados por inflamação devido a infecção patogénica, levando a uma pequena hemorragia da mucosa. Os agentes patogénicos da uretrite não-gonocócica são agentes patogénicos tais como bactérias que não o gonococo, por exemplo, pode haver E. coli ou micoplasma, clamídia, etc. Após confirmação da inflamação através da rotina da urina, podem ser feitos mais testes de cultura da urina e de sensibilidade aos medicamentos para ajudar a determinar qual é o patogénio específico e que medicação anti-infecciosa pode ser utilizada para o tratamento da uretrite não-gonocócica.