Actualmente, as principais opções de tratamento para quistos cerebrais são conservadoras e cirúrgicas, nem todos os quistos cerebrais requerem craniotomia.
Nem todos os quistos necessitam de craniotomia. O médico terá de avaliar a localização do cisto, tamanho, manifestações clínicas associadas ao cisto e resposta à medicação antes de fazer um plano de tratamento específico.