A magnitude dos danos causados por um lipoma do cérebro depende da localização do lipoma e se o lipoma está a causar sintomas clínicos significativos, que normalmente não são muito prejudiciais. Cerca de um terço dos doentes com lipomas cerebrais não apresenta quaisquer sintomas e, nos restantes, os sintomas estão geralmente relacionados com o tamanho e a localização do lipoma, por exemplo, os lipomas maiores no corpo caloso tendem a causar convulsões e os lipomas adjacentes ao sistema ventricular podem causar hidrocefalia. Por conseguinte, a gravidade de um lipoma depende frequentemente dos sintomas clínicos que provoca. Se estiver presente uma epilepsia prolongada, é mais prejudicial, ao passo que os doentes que apresentam sintomas assintomáticos ou ligeiros são menos afectados. Os doentes com lipomas cerebrais são aconselhados a procurar rapidamente assistência médica e a seguir um tratamento ativo sob a orientação dos seus médicos para evitar atrasos.