As piscinas interiores podem causar infecções do tracto urinário, frequentemente observadas em doentes com trauma na própria uretra, erosão ou uma diminuição da sua própria resistência, o que pode levar a uma infecção a montante. As bactérias patogénicas nas piscinas podem agarrar-se à uretra externa ou à volta da genitália externa e multiplicar-se anormalmente ou tornar-se mais virulentas, entrando na bexiga a partir da uretra e causando alterações tais como uretrite e cistite. Os doentes podem experimentar urinações frequentes, urgentes, dolorosas, dores na parte inferior do abdómen e mesmo dores na parte inferior das costas. Nesta altura, é necessário ir ao hospital para um teste de urina para identificar as bactérias patogénicas da infecção e dar um tratamento anti-infeccioso direccionado. Também é proibido nadar de novo durante a doença para evitar agravar os sintomas e causar contaminação e infecção noutros pacientes. Quando o sistema imunitário do paciente está em condições normais, a infecção é geralmente menos provável de ocorrer porque o corpo tem normalmente alguma resistência a bactérias exógenas. Contudo, a contaminação patogénica pode ocorrer em condições patogénicas, especialmente se a área genital externa for exposta a contaminantes durante demasiado tempo, o que pode aumentar a probabilidade de infecção.