As principais causas de trombocitopenia são: 1. produção insuficiente de plaquetas, tais como anemia aplástica, leucemia aguda e infecções, ou devido à acção de substâncias tóxicas, medicamentos, tais como benzeno, xileno, ciclofosfamida e outras substâncias nocivas na medula óssea, a proliferação ou crescimento e maturação de células poliméricas na medula óssea é prejudicada, causa produção insuficiente de plaquetas e uma diminuição do número de plaquetas; 2. destruição excessiva de plaquetas, observada em Alguns medicamentos, tais como sulfato, cloranfenicol, aminopirina e outros medicamentos ou infecções comummente utilizados, através do mecanismo imunitário o corpo produz anticorpos antiplaquetários, resultando na destruição excessiva das plaquetas do corpo e numa diminuição do seu número. Pode também ser observada em trombocitopenia imunológica primária (ITP), coagulação intravascular difusa (DIC), trombocitopenia trombótica (TTP), bem como trombocitopenia induzida por heparina, lúpus eritematoso sistémico, e trombocitopenia associada ao VIH. 3. As anomalias na distribuição plaquetária são mais comumente observadas em hipersplenismo, ou esplenomegalia, causada por várias razões. A retenção excessiva de plaquetas no baço pode causar uma redução significativa do número de plaquetas no sangue.