A ressonância magnética do cancro nasofaríngeo pode ver que o sinal do tecido canceroso nasofaríngeo é mais elevado do que o do tecido muscular circundante. Se for feita uma RM melhorada, o melhoramento pode ser mais óbvio e a intensidade do sinal do tecido tumoral é mais uniforme, se houver necrose local, a intensidade do sinal pode ser menos uniforme. Através da RM pode descobrir se o cancro nasofaríngeo invadiu o espaço parafaríngeo e o espaço faríngeo posterior, se existem metástases linfonodais profundas do pescoço e outras manifestações relacionadas, e pode determinar a relação entre o cancro nasofaríngeo e os vasos sanguíneos circundantes do pescoço. Quando a RM é feita para o cancro nasofaríngeo, é mais vantajosa do que o exame CT porque a resolução da RM no julgamento dos tecidos moles é superior à da TC, que é principalmente para julgar se há destruição óssea e outras condições relacionadas com o cancro nasofaríngeo. A RM é um método para examinar o cancro nasofaríngeo, mas clinicamente, ainda é necessário fazer biopsia nasofaríngea para a patologia para confirmar o diagnóstico.