Há mais medicamentos disponíveis para úlceras penianas, e são utilizados diferentes medicamentos para diferentes causas de úlceras penianas, tais como aciclovir, vaprovir e famciclovir para úlceras penianas causadas por herpes genital. Para aqueles com lesões cutâneas, as lesões podem ser lavadas localmente com 0,9% de solução salina ou 3% de ácido bórico para manter a área afectada limpa e seca.