As principais diferenças entre a gripe A e a gripe B são as seguintes.
Diferentes agentes patogénicos: A gripe A é causada pelo vírus da gripe A, que é mais contagioso e apresenta uma epidemia violenta e generalizada, e o vírus é mais propenso à mutação; a gripe B é causada pelo vírus da gripe B e é, na sua maioria, uma epidemia limitada.
Diferentes graus de sintomas: Ambos têm febre, arrepios, dores musculares generalizadas, fraqueza, dores de cabeça e tonturas, mas a gripe A é mais grave.
O tratamento difere: o tratamento anti-influenza virus (por exemplo oseltamivir, paramivir, etc.) é a base da gripe A e da gripe B, mas a amantadina só é utilizada para a gripe A.