Pode ser hereditário, e estudos têm demonstrado que a heterocromia congénita da íris está principalmente relacionada com factores genéticos. Se os pais têm genes que causam a heterocromia da íris, podem transmiti-la aos seus filhos, mas não é absoluta, e a maioria dos casos não afecta a saúde do paciente, pelo que não há necessidade de se preocupar demasiado. Na maioria dos casos, não é necessário preocupar-se muito com isso.