Na utilização clínica da Azitromicina para o tratamento da infecção por Mycoplasma pneumoniae, geralmente em média para cerca de 1-2 cursos de tratamento, especialmente para uma infecção inicial relativamente ligeira de Mycoplasma pneumoniae causada por bronquite, pneumonia, etc., o uso da Azitromicina 1 curso de tratamento é também cerca de 2 semanas para se conseguir uma cura completa. Para alguns doentes com baixa imunidade, é fácil ter recorrência de Mycoplasma pneumoniae no corpo devido a uma depuração pouco clara, pelo que geralmente podem ser utilizados 2 cursos de tratamento, por exemplo, cerca de 1 mês. Contudo, os efeitos secundários da azitromicina são principalmente irritação gastrointestinal, manifestada como náuseas, vómitos, diarreia, pelo que o curso de utilização é ajustado de acordo com a reacção do doente, e se os efeitos secundários forem mais óbvios, também se pode escolher quinolonas, como a levofloxacina.