Há três períodos após a infecção, nomeadamente a fase aguda, a fase assintomática e a fase da SIDA. A fase aguda ocorre cerca de 2-4 semanas após a infecção inicial. Alguns doentes infectados podem apresentar febre, mal-estar geral, dores de cabeça, náuseas, vómitos, diarreia, dores articulares, gânglios linfáticos inchados, etc., mas não urinação frequente ou urgente. Na fase assintomática, os doentes não apresentam frequentemente sintomas óbvios e podem durar cerca de 6-8 anos. Eventualmente o doente entra na fase da SIDA, na qual as principais manifestações são febre, suores nocturnos, diarreia com duração superior a um mês, acompanhada de perda de peso superior a 10%, e pode ser seguida de várias infecções, apenas quando a inflamação do tracto urinário pode aparecer a realização de urinações frequentes e urgentes.