Normalmente vai-se ao departamento de cirurgia anorectal, e quando acompanhado de diarreia grave e dores abdominais, pode-se ir ao departamento de gastroenterologia.
Além disso, quando a incontinência fecal é secundária ao parto vaginal, deve consultar um obstetra e um ginecologista; quando a incontinência fecal é secundária à diabetes, deve consultar um endocrinologista; e para pacientes com demência ou doença de Parkinson, pode consultar um neurologista.