As infecções por micoplasma em crianças têm a possibilidade de se auto-regenerarem clinicamente, mas a proporção de auto-regeneração é pequena, sendo fácil deixar sequelas. Recomenda-se a consulta atempada de um médico e a normalização do uso de medicamentos, o que favorece a melhoria da doença.
Num pequeno número de casos, as infecções por micoplasma nas crianças podem ser curadas sem tratamento. No entanto, a utilização precoce de antibióticos adequados pode reduzir os sintomas e encurtar o curso da doença, reduzir a atelectasia pulmonar e outras sequelas do tubo de lançamento, pelo que continua a ser recomendada a consulta atempada de um médico, sob a orientação do médico, e a utilização normalizada da terapêutica medicamentosa. São preferidos os macrólidos, como a azitromicina.
Alguns casos não são sensíveis aos macrólidos, pelo que é necessário pesar os prós e os contras sob a orientação do médico e escolher outros medicamentos para o tratamento. Se houver uma combinação de infeção bacteriana, pode ser escolhido um tratamento antibiótico específico de acordo com o exame etiológico e sob a orientação do médico. A maioria das crianças tem um bom prognóstico após o tratamento ativo.