Os vírus mais comuns que causam IU virais incluem o vírus do herpes simplex ou alguns vírus do papiloma humano, que podem ser transmitidos através do contacto sexual. A apresentação típica de uma IU viral é geralmente uma pápula ou bolha na uretra, mas os sintomas de irritação urinária não são particularmente pronunciados e pode haver uma dor ligeira durante a micção. Os doentes com uretrite viral devem ser tratados com terapia antiviral para o vírus infectante, bem como para os seus parceiros sexuais. É também importante cuidar da higiene pessoal e verificar a existência de infecções de transmissão sexual genital. Se estas infecções sexualmente transmissíveis não forem erradicadas, é provável que esta IU viral se repita com o tempo, pelo que é importante que os pacientes com IU virais sejam prontamente atendidos por um hospital.