A clamídia é um organismo mais pequeno que uma bactéria, mas maior que um vírus, e é um parasita intracelular especializado que se assemelha a bactérias e vírus. A clamídia é patogénica para os seres humanos: Chlamydia psittaci, Chlamydia trachomatis e, mais recentemente, Chlamydia pneumoniae. Para além de testes clínicos tais como testes de esfregaço, testes de ligação do complemento e testes de microimunofluorescência, a cultura directa de células pode ser utilizada para isolar a Chlamydia. As tetraciclinas e a eritromicina são eficazes, tal como as quinolonas e outros medicamentos antibacterianos. Mycoplasma: o menor organismo de vida livre conhecido e a mais pequena célula procariótica. É um microrganismo procariótico maior do que um vírus e mais pequeno do que uma bactéria, que se distingue pela ausência de uma parede celular. Como resultado, as células são moles, variáveis e altamente polimórficas. O Mycoplasma é outro grupo de patogénios microscópicos diferentes das bactérias e fungos, com mais de 80 espécies no género Mycoplasma. As três causam infecções do tracto geniturinário. As infecções do Mycoplasma genitalium causam uretrite não-gonocócica nos homens e principalmente infecções não-gonocócicas do tracto geniturinário nas mulheres. Nos homens, esta caracteriza-se por formigueiro, ardor e dificuldade em urinar e, nalguns casos, urinação frequente. O orifício uretral é ligeiramente vermelho e inchado, com uma descarga fina, e alguns pacientes são assintomáticos. Nas mulheres, os sintomas são aumento da leucorreia, queimadura na uretra ou doença inflamatória pélvica, doença inflamatória tubária e outras causas de infertilidade, aborto espontâneo e gravidez ectópica. Quando o Mycoplasma e a Clamídia infectam o corpo, primeiro invadem as células epiteliais colunares e crescem e multiplicam-se dentro das células, e depois entram nas células do sistema de macrófagos mononucleares para proliferarem. À medida que o micoplasma e a clamídia se multiplicam dentro das células, causam a morte das células infectadas, ao mesmo tempo que evitam as defesas imunitárias do hospedeiro e recebem protecção intermitente. O mecanismo patogénico do micoplasma e da clamídia é a inibição do metabolismo das células infectadas, lise e destruição das células e a libertação de lisozima, efeitos citotóxicos dos metabolitos, causando reacções metamórficas e auto-imunidade. Quando o corpo é infectado com micoplasma e clamídia, produz-se uma imunidade específica, mas esta imunidade é fraca e de curta duração e, portanto, as infecções por micoplasma e clamídia tendem a causar infecções persistentes, recorrentes e latentes. O local mais comum de invasão do micoplasma e da clamídia no tracto genital feminino é o colo do útero, que se pode espalhar para cima para causar endometrite, tubite, doença inflamatória pélvica, bem como uretrite aguda e adenite vestibular. Nas mulheres grávidas, as infecções por micoplasma e clamídia podem causar oftalmia neonatal e pneumonia quando o feto passa pelo canal de parto. As infecções por micoplasma e clamídia nas mulheres nem sempre causam sintomas, e se causam, variam dependendo do local da infecção. Por exemplo, a infecção do colo do útero pode causar erosão cervical, edema da mucosa cervical, aumento da leucorreia (purulento) e hemorragia de contacto, enquanto que a infecção das trompas de falópio pode causar dor abdominal inferior, dores nas costas e esterilidade. Geralmente, nenhum destes sintomas é específico. O micoplasma e a clamídia podem ser transmitidos através do contacto sexual, mas também através das mãos, olhos, toalhas, roupa, banhos, cómoda e piscinas. A infecção é facilmente contraída através do sexo com mais de uma pessoa, quando o parceiro masculino tem uma IU, e através de más práticas de higiene. Por conseguinte, a chave para prevenir a infecção é a limpeza e a boa higiene pessoal.