Como tratar uma criança com doença cardíaca congénita começa com um tratamento geral, quando o foco principal é o repouso e a redução da actividade para evitar o aumento da carga sobre o coração. Também pode dar ao seu filho oxigénio apropriado, por exemplo, para aliviar os sintomas de privação de oxigénio. Além disso, se uma criança com doença cardíaca congénita tiver outros problemas, tais como insuficiência cardíaca ou hipertensão pulmonar, a medicação pode ser utilizada para aliviar os sintomas, ajudar a melhorar a apresentação e prolongar a sobrevivência. Como a cardiopatia congénita é uma malformação do coração, a cirurgia é necessária, mas o momento da cirurgia tem de ser determinado no contexto da apresentação da criança, incluindo a idade e o tipo de cardiopatia congénita. A cirurgia pode ser realizada de coração aberto, ou para defeitos cardíacos congénitos mais simples, pode ser utilizado o tratamento intervencionista, que é menos invasivo. Em geral, é necessária uma abordagem abrangente às doenças cardíacas congénitas, sendo utilizado tratamento geral ou medicação para aliviar os sintomas da criança até a cirurgia ser realizada, e depois, dependendo do desempenho e tolerância da criança, a cirurgia pode ser escolhida no momento certo.