As causas da perda da mucosa oral são multifacetadas e envolvem numerosas doenças. Existem medicamentos e factores físicos e químicos, e a perda de mucosa oral pode também ser uma manifestação de uma doença sistémica na cavidade oral. Em qualquer caso, a causa exacta da doença precisa de ser determinada pela combinação de sintomas, sinais e testes auxiliares.