Geralmente, a espessura do endométrio é inferior a 10mm, mas desde a puberdade até à menopausa, a espessura do endométrio muda continuamente com o ciclo menstrual, um processo de mudança contínua. Durante o ciclo feminino, como o ciclo dos ovários, o endométrio é afectado pela secreção de hormonas femininas pelos ovários e também sofre uma série de alterações cíclicas. Quando há folículos em desenvolvimento e maturação no ovário, sob a acção do estrogénio segregado pelo ovário, o epitélio endometrial e as células mesenquimais mostram um estado proliferativo chamado fase proliferativa, com uma espessura endometrial de 1-3mm, isto é, durante os 5-14 dias do ciclo menstrual, após a ovulação, forma-se o corpo ovariano lúteo, e sob a acção sinérgica da progesterona e do estrogénio, o endométrio mostra uma resposta secretora, chamada fase secretora, esta fase é durante a 15-28 dias, a espessura do endométrio é de 5-10mm, se os óvulos não forem fertilizados, o corpus luteum ovariano degenera, o nível de estrogénio e progesterona diminui, o endométrio perde o suporte das hormonas sexuais, há degeneração, necrose e esfoliação do tecido, o endométrio necrótico mistura-se com o sangue e tem alta, neste momento chega a menstruação, apenas a camada basal do endométrio é retida durante o período menstrual. Por conseguinte, os critérios para a espessura do endométrio são diferentes quando realizados em fases diferentes.