A fenda suprauretral pode ser tratada cirurgicamente.
No entanto, a cirurgia da fenda suprauretral é muito difícil. O cirurgião precisa de ser relativamente bem versado na anatomia da pélvis, bexiga, pénis e uretra, para compreender plenamente as características patológicas da fenda suprauretral, e prestar atenção à protecção dos vasos sanguíneos e nervos que inervam o pénis durante a cirurgia, a fim de alcançar a reconstrução funcional máxima do pénis e da uretra. A reconstrução do colo vesical é também muito difícil, exigindo reimplante ureteral e reconstrução do músculo do pescoço para se conseguir o controlo urinário.