O micropénis é definido como um pénis de aparência normal mas com menos de 2,5 desvios de comprimento em relação ao comprimento médio para a sua idade, mas faltam valores de referência de referência de referência de referência de referência de autoridade. Como este diagnóstico é psicologicamente stressante para os homens e tem geralmente um impacto sério na auto-confiança, deve ser dada especial atenção à medição, segurando a cabeça do pénis o mais direito possível de modo a que o seu comprimento corresponda ao comprimento de um pénis totalmente erecto e utilizando uma fita métrica para medir a distância desde a frente da sínfise púbica até à ponta da cabeça do pénis.
Muitos homens com desenvolvimento normal do pénis comparam frequentemente o seu pénis com o de outros homens, e se descobrirem que é mais curto do que outros homens, podem ter baixa auto-estima e medo e procurar ajuda médica. No caso das crianças, é necessário julgá-lo de forma diferente, de acordo com a sua idade específica.